Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chp1P61022 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms