Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3eP60229 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms