Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms