Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PctpP53808 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PctpP53808 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PctpP53808 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PctpP53808 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PctpP53808 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PctpP53808 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PctpP53808 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PctpP53808 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PctpP53808 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PctpP53808 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PctpP53808 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PctpP53808 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PctpP53808 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PctpP53808 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PctpP53808 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PctpP53808 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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