Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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