Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhox5P52651 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms