Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Upp1P52624 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upp1P52624 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upp1P52624 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp1P52624 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upp1P52624 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms