Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms