Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx1P43345 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms