Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms