Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdf5P43027 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms