Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf9P41274 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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