Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms