Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lig1P37913 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lig1P37913 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms