Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1aP36536 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms