Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprkP35822 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprkP35822 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprkP35822 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprkP35822 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprkP35822 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprkP35822 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms