Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Mmp13P33435 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Mmp13P33435 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Mmp13P33435 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Mmp13P33435 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Mmp13P33435 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Mmp13P33435 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Mmp13P33435 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Mmp13P33435 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp13P33435 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Mmp13P33435 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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