Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hoxc11P31313 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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