Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd28P31041 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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