Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms