Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms