Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa5P28312 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms