Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

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Length 487 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Htr3aP23979 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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