Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZfaP23607 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZfaP23607 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms