Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsta3P23591 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms