Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BdnfP21237 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BdnfP21237 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms