Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnc2P20801 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms