Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PdgfaP20033 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PdgfaP20033 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PdgfaP20033 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PdgfaP20033 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PdgfaP20033 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PdgfaP20033 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PdgfaP20033 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PdgfaP20033 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PdgfaP20033 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PdgfaP20033 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms