Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms