Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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