Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd44P15379 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd44P15379 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms