Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt1P13864 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt1P13864 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms