Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb1P12658 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb1P12658 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Calb1P12658 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms