Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms