Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnfP06804 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnfP06804 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnfP06804 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnfP06804 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnfP06804 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnfP06804 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnfP06804 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnfP06804 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnfP06804 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnfP06804 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TnfP06804 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnfP06804 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnfP06804 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnfP06804 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnfP06804 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TnfP06804 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TnfP06804 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnfP06804 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnfP06804 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnfP06804 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnfP06804 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnfP06804 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnfP06804 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnfP06804 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnfP06804 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnfP06804 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TnfP06804 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnfP06804 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnfP06804 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnfP06804 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnfP06804 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnfP06804 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TnfP06804 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TnfP06804 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms