Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04213 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04213 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04213 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04213 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04213 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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