Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01810 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01810 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01810 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01810 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01810 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01810 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01810 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01810 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01810 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01810 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01810 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01810 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01810 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01810 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01810 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01810 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01810 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01810 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01810 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms