Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01656 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01656 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01656 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01656 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01656 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01656 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01656 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01656 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01656 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01656 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01656 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01656 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01656 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01656 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01656 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01656 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01656 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01656 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01656 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01656 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01656 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01656 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01656 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01656 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01656 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01656 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01656 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01656 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01656 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01656 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01656 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01656 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01656 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01656 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01656 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01656 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01656 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01656 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01656 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P01656 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01656 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01656 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01656 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01656 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01656 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01656 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01656 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01656 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01656 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01656 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P01656 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms