Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01641 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01641 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01641 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01641 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01641 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01641 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01641 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms