Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms