Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd160O88875 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd160O88875 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd160O88875 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd160O88875 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd160O88875 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cd160O88875 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cd160O88875 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd160O88875 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms