Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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