Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cfdp1O88271 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cfdp1O88271 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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