Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn4O70507 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms