Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms