Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms