Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffaO54786 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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DffaO54786 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DffaO54786 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffaO54786 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffaO54786 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffaO54786 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffaO54786 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffaO54786 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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DffaO54786 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffaO54786 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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DffaO54786 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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DffaO54786 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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DffaO54786 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffaO54786 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffaO54786 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffaO54786 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffaO54786 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffaO54786 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffaO54786 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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DffaO54786 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffaO54786 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffaO54786 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffaO54786 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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DffaO54786 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffaO54786 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffaO54786 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffaO54786 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffaO54786 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffaO54786 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffaO54786 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffaO54786 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffaO54786 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffaO54786 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffaO54786 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffaO54786 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffaO54786 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffaO54786 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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DffaO54786 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffaO54786 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffaO54786 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffaO54786 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DffaO54786 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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DffaO54786 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms