Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek2O35942 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek2O35942 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms