Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TnxbO35452 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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TnxbO35452 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TnxbO35452 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TnxbO35452 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TnxbO35452 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
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