Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna3O35344 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kpna3O35344 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kpna3O35344 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kpna3O35344 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kpna3O35344 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kpna3O35344 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kpna3O35344 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kpna3O35344 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kpna3O35344 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kpna3O35344 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kpna3O35344 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kpna3O35344 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kpna3O35344 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Kpna3O35344 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Kpna3O35344 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kpna3O35344 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kpna3O35344 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms